廈門大學(xué)臺(tái)灣研究院前身為廈門大學(xué)臺(tái)灣研究所，成立于1980年7月9日，是全國(guó)最早成立的臺(tái)灣研究學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)，系教育部與福建省共建單位。下設(shè)政治、經(jīng)濟(jì)、歷史、文學(xué)、兩岸關(guān)系5個(gè)研究所和院辦公室、文獻(xiàn)信息中心、《臺(tái)灣研究集刊》編委會(huì)。2004年2月19日經(jīng)廈門大學(xué)批準(zhǔn)，廈門大學(xué)臺(tái)灣研究所改制為廈門大學(xué)臺(tái)灣研究院，現(xiàn)有編制43名，其中教授9人，副教授10人。

　　建院20多年來(lái)，臺(tái)灣研究院以“歷史地、全面地、實(shí)事求是地認(rèn)識(shí)臺(tái)灣，促進(jìn)海峽兩岸學(xué)術(shù)交流，為祖國(guó)統(tǒng)一大業(yè)服務(wù)”為宗旨，致力于臺(tái)灣政治、社會(huì)、經(jīng)濟(jì)、歷史、文學(xué)、法律、文化教育以及兩岸關(guān)系等方面的研究。截至2003年底，全院共出版有關(guān)臺(tái)灣研究的專著、論文集、資料集等122部，發(fā)表學(xué)術(shù)論文1800多篇。1988年以來(lái)，在國(guó)家以及教育部、省、市社會(huì)科學(xué)成果的各項(xiàng)評(píng)比中，本院撰寫的著作、論文共獲得優(yōu)秀科研成果獎(jiǎng)103項(xiàng)。本院主辦的《臺(tái)灣研究集刊》（1983年創(chuàng)刊），是全國(guó)最早創(chuàng)辦的專門研究臺(tái)灣問題的學(xué)術(shù)季刊，被海內(nèi)外學(xué)術(shù)界譽(yù)為在臺(tái)灣研究領(lǐng)域具有重大影響的權(quán)威刊物，已先后列入“中文社會(huì)科學(xué)引文索引來(lái)源期刊”、“中國(guó)人文社會(huì)核心期刊”、“中國(guó)學(xué)術(shù)期刊綜合評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源期刊”，并于2001年入選“中國(guó)期刊方陣”，目前《臺(tái)灣研究集刊》在影響因子方面，排在港澳臺(tái)問題類刊物的第一位。

　　臺(tái)灣研究院在進(jìn)行系統(tǒng)的基礎(chǔ)研究和理論研究的同時(shí)，注重開展現(xiàn)實(shí)問題的研究，不僅承擔(dān)和完成國(guó)家和省部級(jí)的大量科研課題，還完成了各級(jí)對(duì)臺(tái)工作部門委托的大量調(diào)研課題。

　　臺(tái)灣研究院重視對(duì)外學(xué)術(shù)交流，與海內(nèi)外學(xué)術(shù)文化界建立了廣泛的學(xué)術(shù)交流與合作關(guān)系。研究院每年除接待大量的臺(tái)、港、澳及外國(guó)的專家、學(xué)者及其他人士外，還經(jīng)常選派科研人員及研究生赴境外進(jìn)行學(xué)術(shù)交流。僅2002-2003年兩年，我院就接待來(lái)自臺(tái)灣的專家、學(xué)者及其他人士489人次，香港學(xué)者8人次，外國(guó)專家學(xué)者、記者及其他人士63人次，赴境外進(jìn)行學(xué)術(shù)交流32人次；2000年至2003年四年就召開了13次學(xué)術(shù)研討會(huì)，其中海峽兩岸學(xué)者共同參加的12次。目前與我院建立學(xué)術(shù)交流交往或合作關(guān)系的境外學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)主要有：臺(tái)灣大學(xué)國(guó)家發(fā)展研究所，臺(tái)灣政治大學(xué)中山人文與社會(huì)科學(xué)研究所、國(guó)際關(guān)系研究中心，臺(tái)灣中國(guó)文化大學(xué)大陸研究所，臺(tái)灣淡江大學(xué)大陸研究所、臺(tái)灣中山大學(xué)政治學(xué)研究所、中山學(xué)術(shù)研究所、大陸研究所，臺(tái)灣暨南國(guó)際大學(xué)公共行政與政策學(xué)系、臺(tái)灣云林科技大學(xué)漢學(xué)資料整理研究所、臺(tái)灣東吳大學(xué)政治系，香港大學(xué)政治與公共行政學(xué)系，新加坡東亞研究所，美國(guó)亞太安全研究中心，日本創(chuàng)價(jià)大學(xué)等。

　　臺(tái)灣研究院現(xiàn)有中國(guó)近現(xiàn)代史（臺(tái)灣史研究方向）、區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)（臺(tái)灣經(jīng)濟(jì)和兩岸經(jīng)貿(mào)關(guān)系方向）兩個(gè)博士點(diǎn)，以及中外政治制度、區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)、專門史、中國(guó)現(xiàn)當(dāng)代文學(xué)等4個(gè)碩士點(diǎn)。

　　臺(tái)灣研究院具有較好的研究條件，現(xiàn)擁有一幢面積1700多平方米的辦公樓，文獻(xiàn)信息中心收藏臺(tái)灣出版的圖書20000多冊(cè)、超過400 G數(shù)據(jù)量的臺(tái)灣《中國(guó)時(shí)報(bào)》光盤、報(bào)刊資料合訂本13000多冊(cè)、長(zhǎng)年訂閱臺(tái)灣及外文報(bào)刊230多種。每個(gè)辦公所都配備有計(jì)算機(jī)和電話，并已建立了院內(nèi)局域網(wǎng)、臺(tái)灣研究數(shù)據(jù)庫(kù)及全文檢索系統(tǒng)和各辦公所的工作站終端，可與國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行聯(lián)接和數(shù)據(jù)傳輸。

　　臺(tái)灣研究院于1997年和1999年先后被列為國(guó)家“211工程”的重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科和福建省重點(diǎn)學(xué)科。以臺(tái)灣研究院為母體組建的廈門大學(xué)臺(tái)灣研究中心，薈集了全國(guó)研究臺(tái)灣的精英，2001年入選為“教育部人文社會(huì)科學(xué)百院重點(diǎn)研究基地”。經(jīng)過20多年的建設(shè)，臺(tái)灣研究院已經(jīng)發(fā)展成為具有較高的研究水準(zhǔn)、較完整的研究領(lǐng)域、以中青年為骨干的全國(guó)臺(tái)灣研究重鎮(zhèn)之一。在科研隊(duì)伍、研究成果以及在國(guó)內(nèi)外的影響等方面，均居國(guó)內(nèi)領(lǐng)先地位，在國(guó)際學(xué)術(shù)研究相關(guān)領(lǐng)域也享有較高學(xué)術(shù)地位。

　　臺(tái)灣研究院的“十五”規(guī)劃和2010年遠(yuǎn)景規(guī)劃是，通過深化管理體制和科研體制改革，發(fā)揮多學(xué)科綜合研究的優(yōu)勢(shì)，逐步形成臺(tái)灣區(qū)域性綜合研究的重點(diǎn)學(xué)科，把臺(tái)灣研究院建成全國(guó)一流、世界領(lǐng)先的臺(tái)灣研究基地，成為全國(guó)最好的臺(tái)灣研究人才庫(kù)、思想庫(kù)和信息庫(kù)。