上海東亞研究所成立于1995年11月，是專門從事東亞問題研究的民間學術機構，其著重點在于臺、港、澳問題研究，輻射至中、日、美關系。

　　上海東亞研究所堅持解放思想、實事求是、理論聯(lián)系實際的學風，以“擺事實、講道理、明是非、求共識”為方針，對東亞各國及對海峽兩岸動態(tài)信息進行跟蹤研究，要求基礎研究和動態(tài)研究并重，以科學性、預見性和可行性并重，力爭出思想、出戰(zhàn)略，并廣泛吸納上海學術精英的思想與成果，以民間的思考為政論的決策服務，以理論研究成果為我國社會主義現(xiàn)代化建設和獨立自主的和平外交政策服務。

　　上海東亞研究所實行以所務會為領導的所長負責制，下設學術委員會、理事會，力圖團結(jié)上海學者專家、社會活動家、企業(yè)家共同參加研究與學術活動。經(jīng)費由理事會籌措與提供。

　　上海東亞研究所尚處初創(chuàng)階段，目前正逐步同國內(nèi)外有關學術團體、專家學者建立不同形式的交流合作關系，將舉辦各類學術研討會、報告會、組織參訪、贊助出版、資助科研項目等社會活動。東亞所設有東亞會館，為會員與成員提供餐飲休閑。

　　上海東亞研究所以《東亞動態(tài)》、《東亞專報》為研究所內(nèi)部刊物，并與香港《中國評論》合作，作為喉舌，向社會提供公開成果。同時，贊助出版《東亞叢書》。研究所負責人：

　　顧問：張志群、周明偉、袁采

　　名譽所長：陳佩堯

　　所長：章念馳

　　副所長：胡凌煒

　　所長助理：鐘焰

　　所學術委員會負責人：

　　主任：陳佩堯

　　顧問：高文魁

　　副主任：俞新天、楊潔勉、沈丁立、郭偉鋒、潘振強

　　委員：于申、仇長根、盧秀璋、李秀石、朱政惠、吳寄南、陳鴻壽、周建明、周洪鈞、趙曉雷、林尚立、崔志鷹、葛劍雄、蔡鵬鴻（按姓氏筆劃）

　　所理事會負責人：

　　理事長：劉楓

　　顧問：張竹

　　常務理事：王永光、毛培生、盧詩強、任洪良、李偉兵、陳白淮、洪建一（按姓氏筆劃）